【PART I 聚合?鏈鎖反應（Polymerase Chain Reaction; PCR）之緣起與原理】



第1章 PCR發展之背景與歷史

1-1 PCR：一個二十世紀分子生物學研究的突破性技術

1-2 PCR技術的發展簡史



第2章 典型PCR的反應成分與條件設定

2-1 典型的PCR反應成分

2-2 典型的PCR反應條件

2-3 循環增幅的細節（Details of Cycling Amplification）

2-4 PCR偵測實驗的對照組



第3章 PCR的產率與專一性（Sensitivity and Specificity of PCR）

3-1 PCR反應可能遭遇的問題與改進方法

3-2 PCR反應抑制劑

3-3 增進PCR產率與專一性的試劑

3-4 調整PCR的方法來增進產率或專一性

3-5 長片段與富含GC（GC-rich）的DNA片段之PCR增幅



第4章 PCR的忠誠性（或出錯率）（Fidelity of PCR Amplification）

4-1 PCR的錯誤率（或忠誠性）對我們的研究有何影響？

4-2 聚合?加入錯誤核?酸的機制

4-3 影響PCR忠誠性的因素



【PART II PCR之基礎應用（Basic Applications of PCR）】



第5章 逆向PCR（Inverse PCR; IPCR）：引子背對背的PCR連接反應媒介PCR（Ligation Mediated PCR; LMPCR）

5-1 IPCR對未知序列之增幅

5-2 IPCR應用於刪除突變與定點突變之基因建構

5-3 以連接反應媒介PCR（LMPCR）進行未知序列之增幅

5-4 LMPCR指紋分析（LMPCR Fingerprinting Analysis）

5-5 以LMPCR進行DNA胞內腳紋（in vivo Footprinting）分析



第6章 多重引子PCR（Multiplex PCR; mPCR）與巢狀PCR（Nested PCR）

6-1 多重引子PCR（Multiplex PCR; mPCR）

6-2 巢狀PCR（Nested PCR）



第7章 反轉錄PCR（Reverse Transcription PCR; RT-PCR）

7-1 RT-PCR的用途

7-2 RT-PCR的基本步驟

7-3 反轉錄?的特性與選擇

7-4 單一步驟或兩步驟RT-PCR

7-5 RT-PCR 經常被用於分析特定基因之差異性表現



第8章 定量PCR與即時PCR（Quantitative PCR and Real-time PCR）

8-1 早期定量PCR是一種終端PCR（End-point PCR）的分析方式

8-2 新一代的定量PCR：即時PCR（Real-time PCR）



第9章 應用PCR做全基因體差異性分析（Whole Genome Variation Analysis by PCR）

9-1 RAPD：隨機增幅多型性DNA（Random Amplified Polymorphic DNA）

9-2 AFLP：增幅片段長度多型性（Amplified Fragment Length Polymorphism）

9-3 IRS-PCR：散布性重複序列PCR（Interspersed Repeat Sequence PCR）

9-4 STR-PCR：短而連續重複序列PCR（Short Tandem Repeat PCR）

9-5 CODIS：組合式DNA指標系統（Combined DNA Index System）



第10章 PCR於基因選殖之應用（PCR Mediated DNA Cloning）

10-1 T/A（或稱A/T）選殖（T/A Cloning）

10-2 利用PCR 將目標DNA 兩側加入選殖所需特定限制性內切?之辨識序列

10-3 不需使用連接?或限制性酵素的特殊PCR基因選殖

10-4 使用degenerate引子的PCR與基因建構

10-5 利用PCR 來製備單股目標基因（或DNA）



第11章 利用PCR偵測基因突變（Mutation Detection by PCR）

11-1 已知突變點與突變方式之PCR偵測

11-2 特定基因中之未特定突變點（或型態）之PCR相關偵測



第12章 利用PCR來創造突變（PCR Mediated Mutagenesis）

12-1 利用PCR定點突變（PCR Mediated Site-Directed Mutagenesis）

12-2 以兩步驟PCR方法來製備一長片段插入性突變（Two-PCR Method for Making a Long Insertion Mutant）

12-3 連接子掃描突變（Linker Scanning Mutagenesis; LSM）

12-4 利用PCR進行隨機突變（PCR Mediated Random Mutagenesis）



第13章 結語



英中文索引



?