中華民國審計部獨立行使審計職權，監督政府及其所屬機關預算之執行，並就其運用資源之經濟性、效率性及效果性進行考核，本專案審計報告揭露臺南市政府農業局辦理臺南市新化果菜市場遷建計畫，事前未妥為規劃用地取得作業，且未及時於市場遷建工程招標前與使用者及營運管理者達成設計內容及需求等共識，致延誤遷建計畫推動期程；另未積極辦理冷藏庫新建工程採購作業，且興建決策改採促參招商並簽約後，因促參前置作業未邀請市場攤商參與以取得共識，而再改回機關自辦及終止促參契約，延宕冷藏庫興建進度等，經審計機關促請研謀改善，農業局業已檢討改進，新建市場已自111年12月正式營運，有「全國最美果菜市場」美稱，成為臺南市新興觀光遊憩景點；另冷藏庫新建工程已於113年9月完工，未來新化果菜市場結合冷鏈系統，預估每年蔬果調節量達2,000公噸，有助於天災來襲時穩定蔬果價格，保障消費者與攤商權益。